Dibabak kedua pertandingan, pemain Persega langsung menekan pertahanan Morotai United dengan menampilkan skema bola pendek dari kaki ke kaki. Sehingga, pemain Persega berhasil menjebol gawang Morotai United di menit ke 51 yang dijaga Abdul Muhtalib Lanoni, melalui kaki pemain bernomor punggung 11 Agusrianda Esa, skor menjadi 1-0 untuk Persega.
Pemain Morotai United yang sudah ketinggalan 0-1, melakukan tekanan serangan balik tetapi masih berhasil di bendung pemain pertahanan Persega.
Meski begitu, pemain Morotai United terus melakukan tekanan dan berhasil menjembol gawang Persega yang dijaga Julfikar Laing, di menit ke 56 melalui sundulan kepala Masrul Bahri, karena pemain Morotai United mendapat peluang tendangan sudut, skor pun berubah menjadi 1-1.
Setelah Marotai United menyamakan kedudukan, pemain Persega terus menaikan tempo permainan serta berhasil menjebol jantung pertahanan Morotai United dan berkali kali mengancam gawang Morotai United.
Persega yang mendominasi permainan dan terus menggempur pertahanan Morotai United. Alhasil, di injury time Persega kembali membobol gawang Morotai United di menit ke 89, setelah Persega mendapat kesempatan tendangan pelanggaran yang dilakukan pemain bernomor punggung 6, Hendra Jamin, dari sisi kanan lapangan. Bola yang melambung mengarah tepat sasaran ke mulut gawang tidak mampuh ditepis penjaga gawang Morotai United, skor pun berubah menjadi 2-1 untuk Persega.
